L'eau propre est une composante essentielle d'une aquaculture réussie. Cependant, c'est souvent une rareté. La plupart travaillent avec ce qu'ils ont. Cela va du pur au très pollué. Le fait même de produire des animaux dans des systèmes fermés ou partiellement fermés conduit à la pollution. Les entrées et les sorties déterminent le degré. Les intrants comprennent les aliments pour animaux, les matières végétales et les animaux morts et mourants, les excréments et tout autre matériel qui pourrait être ajouté ou produit par ce qui est présent dans l'environnement immédiat. Si ceux-ci peuvent être éliminés, le déséquilibre immédiat peut être corrigé. Les charges d'azote et de phosphore contribuent à la détérioration de la qualité de l'eau qui, à son tour, met à rude épreuve l'écosystème, entraînant des conditions défavorables qui affectent négativement la productivité. Nous proposons des outils qui peuvent aider les agriculteurs à nettoyer l'environnement en réduisant ces impacts.